胰岛移植的免疫排斥是非常复杂的过程，细胞免疫和体液免疫都参与了排斥反应。同种移植依赖于CD8＋T细胞；异种移植则是依赖Ⅱ类抗原类CD4＋T细胞。胰岛组织对排斥反应敏感，异种胰岛移植物易被排斥。国外研究者通过实验证明胰岛移植的主要障碍是过客白细胞玷污胰岛组织，导致新鲜胰岛迅速排斥。有人认为Ia阳性细胞对移植物免疫性排斥的触发起主要作用。
胰岛移植物的免疫排斥的防治方法的研究进展有：
免疫抑制剂
据报道，泼尼松及抗淋巴细胞蛋白是较有效的抗排斥制剂，可使胰岛异体移植物存活时间明显延长。任何浓度的新型免疫抑制剂FK506在人胎胰或胰岛移植中可能是一种有用的免疫抑制剂。
改变移植物的致免疫性
供体组织预处理或在移植前经体外培养均可减少移植物的致免疫性。
免疫隔离
这是目前研究最多，效果颇佳的一种方法，将在今后的胰岛移植抗排异方面占有主要地位。其机制是将胰岛置于半透膜容器内，这种斗透膜可阻止介导排斥的细胞或分子进入，而胰岛素与葡萄糖可自由通过。其中微囊化胰岛是研究的热点。据报道，在各种免疫隔离膜中，5％琼脂糖胶加5％聚苯乙烯磺酸微囊化效果最为理想。
胰β细胞株的建立为防治移植排斥反应开辟了新的思路和途径。日本有报道，免疫隔离膜微囊化胰β细胞株移植体外实验表明：5％琼脂糖胶加5％聚苯乙烯磺酸微囊化胰β细胞株MIN6在高糖浓度下刺激时，显示良好的胰岛素分泌及释放反应。不用免疫抑制剂的鼠皮下移植实验表明，这种人工生物胰既能保护移植胰β细胞株MIN6免受排斥反应，也能提供一个微环境以维持胰β细胞株MIN6对糖刺激有效的胰岛素分泌反应性。
尽管胰岛移植已取得很大成效，但如何防止免疫排斥反应这个问题没有完美解决，临床远期疗效仍不甚理想。目前正进行以下的研究：改进胰岛的分离和制备技术，以获得足够数量的高质量的胰岛组织；改良胰岛的保存方法；筛选和研制较好的免疫抑制剂；加强免疫隔离材料的研制；降低供体的免疫源性，提高受体的免疫耐受性等。随着分子生物学技术和相关科学的发展，如细胞混合培养、转基因技术、β细胞株的建立，异源性胰岛细胞的移植等一系列方法的兴起，胰岛移植免疫排斥反应必将找到一个更好的防治方法。
