蒙药方剂是根据治病需求，遵循蒙医配方理论配合组成的成方。它具有综合治疗的作用，用药量小，灵活性强，并以调和药物毒性、减少不良反应，达到安全治病防病为目的。
在蒙医文献、本草及正式出版物所记载的成方数以万计，但现代临床常用的约在1000左右。下面就临床各科代表性药方举例如下：
治疗赫依症方
如：八味清心沉香散
处方：沉香10克，广枣、天竺黄、北沙参、红花、檀香各4克，紫檀、肉豆蔻各2克。
制法：以上八味，分别挑选，研碎成细粉，过筛混匀。
功用：平喘，止咳，镇痛。用于赫依、血相搏致气喘，气管炎，吐泡沫痰，胸部刺痛，心悸等症。
用法与用量：成人一次2-3克，一日2-3次，温开水送服。
治疗协日症方
如：清热大黑散
处方：黑冰片7克，土木香5克，地格达、土黄连、麝香、诃子、余甘子（或栀子）、毛诃子（或川楝子）、牛黄、天竺黄、红花各2克。
制法：以上11味，分别挑选，除麝香、牛黄外，其余9味粉碎成细粉，过筛；另将麝香、牛黄研细，与上述粉配研，混匀。
功用：清协日热。用于热协日病，目肤发黄，瘟疫，瘟疫陷胃，口渴烦燥，消化不良。
用法与用量：一次1.5-3克，一日1-2次，凉开水或冰糖水送服。
治疗巴达干症方
如：四味光明盐汤
处方：光明盐、诃子、荜茇、干姜等份。
制法：以上四味，粉碎成粗粉，过筛，混匀。
功用：温胃，消食，解毒。用于消化不良，药物、食物中毒。
用法与用量：成人一次３-5克，一日1-3次，水煎服。
治疗血症方
如：三果汤
处方：栀子2份，诃子、川楝子各1份。
制法：以上3味，粉碎成粗粉，过筛，混匀。
功用：清热，解毒，凉血澄血之浊清。用于新旧血热，瘟热，目赤，眩晕头痛，病血与精血相搀。
用法与用量：一次3-5克，一日1-3次，水煎放凉后服。
治疗黄水症方
如：四味文冠木汤
处方：文冠木5克，毛诃子（或川楝子）3克，诃子、余甘子（或栀子）各1克。
制法：以上四味，研碎成粗粉，过筛，混匀。
功用：清热，燥黄水。用于热性黄水病，水肿，各种关节炎，湿热性皮肤病症。
用法与用量：成人一次3-5克，一日1-2次，煎服，或皮肤患处煎汤洗。
消粘驱虫方
如：六味荆芥散
处方：玉竹（或羌活）、益母草各3克，信筒子、蓍草各2克，荆芥、盖孜各1克。
制法：以上六味，分别挑选，研碎成细粉，混匀。
功用：杀虫，止痛。用于阴道滴虫病。
用法与用量：一次3-5克，水煎冲洗阴道，或制成栓剂外用。
治疗阏症方
如：十三味牛黄散
处方：牛黄、红花、瞿麦、地格达、菊花、关木通、五灵脂、土木香、木香、沙棘、制波棱瓜子、芫荽子、香青兰等份。
制法：以上13味，除牛黄外，其余12味，分别挑选，粉碎成细粉；另将牛黄研细，与上述粉配研，过筛，混匀。
功用：清热，凉血，止血。用于肝“宝日”病，月经过多，呕血，外伤出血等。
用法用量：成人一次⒈5-3克，一日1-2次，凉开水送服。
破痞方
如：六味硝石散
处方：炒硝石、阿魏、光明盐、干姜、荜茇、胡椒
制法：以上六味，分别挑选，粉碎成细粉，过筛，混匀。
功用：温胃，破石痞。用于食积，食痞，胃脘不适，各种石痞，尿闭腰痛等症。
用法用量：成人一次⒈5-3克，一日1-2次，温开水送服。
消浮肿方
如：十味铁落散
处方：制铁落9克，诃子、毛诃子（或川楝子）、余甘子（或栀子）、拳参、信筒子、辣椒、干姜、荜茇、胡椒各1克。
制法：以上10味，分别挑选，研碎成细粉，过筛，混匀。
功用：消浮肿。用于全身浮肿，眼睑、面部、小腿等浮肿。
用法用量：成人一次⒈5-3克，一日1-2次，温开水送服。
