藏醫學對疾病的診察方法主要有四种：問診、尿診、脈診、色診和試驗診。
問診主要問以下各項。
起病緩急：突然起病多為急症，說不清何時起病多為慢性病。
起病原因：如暴飲暴食而胃痛、嘔吐，受涼而發熱、咳嗽等都有原因可詢問出來。
气候環境：如住所的通風情況，室內溫度和濕度等有一定的診斷參考价值。
職業和家庭：如牧民易患膿包炭疽，某些傳染病可在家庭成員中相互傳染等。
飲食起居：飲食不節，起居失常可導致多种疾病，也為問診的重要內容。
尿診是藏醫學最具特色的診斷方法。藏醫根据尿的色澤、气味等內容來判斷病性、病位。
尿色：青色如沼澤中水為隆病；黃色如珊瑚刺汁為赤巴病；乳白色為培根病；紅色為血液病等。
尿的蒸汽：蒸汽多為增盛熱症，蒸汽少持續久為隱熱症或陳舊熱症，蒸汽時多時少為寒熱錯雜病等。
尿味：發臭者為熱症，味輕微為寒症等等。
尿气泡：泡沫色青且大如牛眼突出者為隆病；泡沫細小色黃為赤巴病；泡沫色如血紅大小不等為血病；泡沫大小不等色如虹呈多种顏色為中毒病等等。
尿漂浮物：其狀如棉團中心稠而四周稀者為赤巴病；其狀如山羊毛，散布尿液中，如小棍挑之挑不出者為隆病；狀如細砂粒者為腎病等等。
尿的浮皮：浮皮較薄為寒症，浮皮較厚為熱症等等。
靜置尿觀察和病變尿分析：把尿靜置后根据尿液的顏色等變化的觀察以判斷疾病的性質。病位等。
脈診与漢醫學有明顯的相似之處。
對脈診的准備、診脈時間、診脈位置、手法輕重、脈象与臟腑、五行、季節的關系等均有詳細而丰富的闡述及大量的經驗資料。如脈的种類分為浮、沉、遲、洪、細、大、小、滑、澀、滿、實、空、數、長、短、緩、緊、弱、粗、硬、柔、促、扁、間歇、慢等20多种病脈。
色診通過診察患者皮膚、眼白、舌頭的顏色以協助判斷疾病。
黃疸者皮膚、眼白出現黃色；隆型人膚色灰暗；赤巴型人膚色偏黃等。隆病人的舌質干而粗糙，舌邊有無數小突起等等。
至于試驗診斷法即診斷性治療，如怀疑有赤巴病可試用苦丁湯治療；怀疑有胃腸急症或虫積病，應五味麝香丸試治；怀疑中毒時，試用二十五味紅花丸治療等等。
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