四医大研制出低密度寡核苷酸基因芯片

时间
2006-04-25

据中国医药报讯

第四军医大学预防医学系郭国祯教授等人采用辐射生物学效应

原理,应用Mprobe软件设计探针筛选参与辐射生物学效应基因,日前成功研制出

一款由143个基因组成的电离辐射相关低密度寡核苷酸基因芯片。该芯片为检测不

同辐射敏感性肿瘤细胞的差异表达基因提供了一个新的技术平台。

基因芯片作为一门新兴技术,其具有高通量、微型化和自动化等特点,被广

泛用于各种组织的表达谱分析。近年来,它主要在电离辐射领域用于检测辐射诱

导的相关基因。但由于高密度芯片针对性不强等原因而影响了该技术的研究和发

展。

为研制一种用于放射领域研究的基因芯片,郭万锋等人选择了与辐射效应相

关的人类细胞凋亡基因、细胞周期基因及DNA损伤修复基因等作为候选基因,通

过对寡核苷酸的合成、肺腺细胞(A549)和肺小细胞癌细胞(NCI-H446)的培养、

基因芯片的杂交、洗涤以及对差异表达基因的检测等技术手段处理后,成功地研

制出这款辐射相关低密度寡核苷酸基因芯片。

研究人员采用RT-PCR检测发现该基因芯片共含有基因143个,其中辐射相关

基因127个,对照基因16个;芯片杂交中出现286个杂交点,平均每个基因两个;

在不同辐射敏感性的A549和NCI-H446细胞中,研究人员筛选出18个差异表达基因,

经检测与芯片结果一致,具有较好的可信度。该结果提示低密度寡核苷酸基因芯

片有较好的敏感性、特异性和重复性,可检测不同辐射敏感性肿瘤细胞的差异表

达基因。

据郭国祯介绍,基因芯片技术的应用虽然越来越广泛,但目前国内仍然还没

有一种适用于放射研究领域的基因芯片。现有的高密度芯片,存在针对性不强、

实验资料繁杂、不利分析运作和耗费高等问题。因此,此次研制的辐射低密度寡

核苷酸基因芯片去掉了众多的干扰因素,有利于生物信息学分析,可筛选出不同

辐射敏感性肿瘤细胞的差异基因,对于从分子水平理解肿瘤细胞的辐射抗性具有

重要作用,该芯片也提供了放射研究领域的一个崭新技术平台。