肺炎衣原体是一种新近发现的病原体，为衣原体属的一个新种。据报道，肺炎衣原体在世界范围内广泛存在，具有慢性化的倾向，并与多种疾病的发病有关。因此，探索有针对性的药物、明确控制衣原体感染的治疗首选药物具有重要价值和实际意义。
最早用于治疗衣原体感染的药物，一是红霉素；二是四环素；三是氯霉素。这几种药物虽然均有良好疗效，但因相对毒副作用大、不良反应多，故而临床应用受到限制，已不再作为当前控制肺炎衣原体感染的首选药物。
近年，随着大环内酯类抗生素新型药物及喹诺酮类抗生素第三代药物的问世，拓展了抗衣原体感染的药物治疗应用范围，其中不乏疗效好、副作用小、相对安全系数高的新药，已被医学界推荐为首选治疗药物，简介如下：
克拉霉素
是被公认为抗肺炎衣原体感染效力最强的药物，无论体外还是体内活性均强于其他抗生素。克拉霉素的通常用法是250毫克或500毫克，每天两次，疗程为7～14天。其吸收入血后可在各种组织中达到有效浓度，尤以肺组织内浓度为最高，能有效杀灭肺炎衣原体，并使患者肺功能得以改善，可作为首选药物之一。
阿奇霉素
是一种大环内酯类新药，吸收后可迅速渗透于肺组织中，在泌尿生殖系统也有很高的药物浓度。一般剂量为0.25克，每日1次，连用3天，隔4天后再用3天，即间隔疗法。也可先静滴3天后改为口服4天的序贯疗法，均有良好疗效。与克拉霉素相比，其抗肺炎衣原体活性虽低些，但不良反应少，患者耐受性好，依从性高，故为目前临床应用的实际首选药物，使用最为广泛。
加替沙星
为第三代喹诺酮类抗生素，对肺炎衣原体有较强的抗菌活性，显著强于环丙沙星和左氧氟沙星。用法为口服400毫克，每日1次，疗程7～14天，治疗肺炎衣原体感染的临床有效率为89％。虽然该药可以作为首选药物，但必须防范其不良反应，包括胃肠道反应、神经系统反应和光毒性。
莫西沙星
也是第三代喹诺酮类抗生素，对肺炎衣原体有较强的抗菌活性，并具有广谱、快速杀菌作用。用法为每次100毫克，每日1～2次，疗程7～14天。不良反应与加替沙星相似，适用于病情较重的肺炎衣原体感染。
多西环素
为四环素类的一种新药，相对副作用少，安全系数高，已取代四环素作为抗肺炎衣原体感染的首选药物之一。用法为每次口服50毫克，12小时1次，首剂宜加倍，疗程10～14天。
其他
大环内酯类中的罗红霉素、泰利霉素，以及喹诺酮类中的司帕沙星、吉米沙星、左氧氟沙星和四环素类中的米诺环素等，在某些情况下也可作为抗肺炎衣原体感染的首选药物。如对上述几种药物不耐受、暂时没有存品或需要几种不同类抗生素联合应用时，可以根据药敏试验结果择优选用。
