那曲地区藏医院自1983年成立以来,在各级党委、政府及上级有关部门的大力支持下，经历了从无到有，从小到大的发展历程。特别是近十年来，那曲地区藏医院紧紧抓住西部大开发历史机遇，努力提高自主创新能力和水平，进一步调整医疗服务结构，转变经济增长方式，始终坚持“科技兴院，人才强院”的发展战略，大力提倡“以病人为中心，树行业新风，创优质服务”的发展理念，全面系统地拓宽服务项目，改善就医环境，提高医疗质量，逐步发展成为集医疗、教学、科研、预防、生产为一体的藏北龙头医疗服务机构。
2004年医院所属两家藏药厂（那曲地区藏药厂、雄巴拉曲神水藏药厂）先后通过了国家GMP认证。2005年成功创建“二级甲等”藏医院。2007年安装配置了HISS系统，使收费管理制度步入科学化、信息化轨道。目前，那曲地区藏医院下辖办公室、医务科、护理部、总务科、门诊部、内科、外科、医技科、藏药厂及心脑血管专科等。目前，医院占地面积为46048平方米，建筑面积12787平方米，其中门诊部建筑面积1524平方米，住院部建筑面积3377平方米。平均每床占地面积77.7平方米，每床病室使用面积7.4平方米。全院共113名在职职工，其中业务人员78名，副高级6名，中级28名，本科学历35名，业务量占地直机关的35%～40%，2008年门诊量2.6万余人次。
