先生制方遣药，务求切含病情，他赞徐泗溪“药性专长”之说，注意选择具有针对性药物，或以单方参入复方，或时方与经方并用。如治胃病，善用《金匮》瓜蒌薤白半夏汤合左金丸，取单方力专而厚。因药“各有功能，可以变易血气以除疾病，此药之力也。”犹如劲兵，专走一路，则先以破垒擒王。辨证用之，每服良药。又如治脾胃病及脘腹痛诸疾，先生善用法半夏，取其引阳入阴，升发脾土之阳气，由阳而化阴，以和胃通阴阳。一患者“脘中时或作 如饥，食即安适，不食则难过殊甚。或如击伤，夜卧则觉有气串动，忽上忽下，大便溏，嗳气泄气则舒，脉弦滑。”先生诊为“肠胃并病，”治当两顾，药用法半夏、橘红衣、旋覆花、无花果、淮小麦、闵果、生米仁、白豆蔻、野茯苓、炒谷芽、神曲、佩兰等。一诊后“脘中作嘈难过业己舒适，肠府逆气串动亦见平伏。”二诊后病即告愈。这其中与法半夏为君药是有很大关系的。
先生治泄泻，尤喜用蛇含石。如曾在接治程门雪先生用调理脾肾法治疗慢性泄泻的处方上写了批语，“此方可服，再加蛇含石四钱”。原为屡服不效的方子，经仲奇先生分析后仅加药一味，多年的宿疾竟出奇地治愈了，由此程门雪老深慕仲奇医术的精通。
先生的治案中，类似的用药经验很多。如治泄泻，他善用海蛤粉、乌梅肉；治淋浊，擅用川萆（艹解）xie、紫贝齿；治不寐，常用法半夏、龙骨、牡蛎；治痢疾，每用禹余粮、赤石脂、莱菔子；治哮喘，则用甜葶苈、鹅管石、法半夏等等。体现出先生原既注重药性专长，又能辩证立方 ，原既守法度，又不拘泥的用药风格。
如治脐腹胀闷，体常畏冷，大便秘结之证，谓“小肠回旋叠积，位居于脐腹中，职同变化受盛”，故责之于“脾肾阳困，气不运行，火府亦呆滞不通。”考诸经旨，“以小肠附丽于左尺，则知小肠受盛变化，当基与肾有连常关系也。”故治以温润通法，药用锁阳、红花、全当归、枳壳、火麻仁、石菖蒲、桃仁、砂仁、川楝子、沉香曲、陈大麦等。方中以锁阳为君，补阳气，益精血，利大便。丹溪谓其“虚人大便燥结者，啖之可代苁蓉。”红花、当归、桃仁为血分药，火麻仁润以肾之，治大便秘结；枳壳、沉香为降气之剂，肺与大肠相表里，肺气降则通大便；砂仁青而走窜，川楝子气薄味厚而降，以助锁阳温通达下之旨；菖蒲利窍，彼以通耳目，此则利后阴；陈大麦平凉滑腻，和胃气而化谷食、消胀闷，含病情以资食治。全方配伍精契，真可谓“分观之而无药弗切乎病情，合观之而无方本乎右法。”
