1．AP显色体系
BCI –OH+NBT→紫色↓
ASO：等位基因特异的寡核苷酸，BCIP：5溴-4氯-3吲哚磷酸，NBT：四氮唑蓝，Pi：磷酸。
2．HRP显色体系
HRP + H2O2[HRP·H2O2]
ODA –NH2 +[HRP ·H2O2]枣→ODA-N = ODA/棕色↓+HRP +H2O
ODA：邻-联茴香胺。
3．ABC显色体系
DNA –B+ SA – AP→DNa – B – SA或DNa – B +SA - BAP→DNa –B –SA –BAP
经上述两反应，把AP连接在DNA上以后，再进行AP酶显色。这里SA为Streptavidin（链酶亲合素），BAP为生物素化的磷酸酶，B为生物素（biotin），ABC为Avidin – Biotin - Enzyme com－plex, 即亲合素- 生物素-酶复合物。
以上反应AP亦可用HRP代替。
表18-3曱核酸探针的标记分子
| 标记物性质 | 标记分子 | 标记方法 | 杂交体的检测法 |
| 放射性分子 | [α-32P]dNTP | NT、PCR、RPI | 放射自显影或计数 |
| [γ-32P]dNTP | TL | 放射自显影或计数 | |
| 125I | 碘化 | 放射自显影或计数 | |
| 35S | NT | 放射自显影或计数 | |
| 3H | NT | 放射自显影或计数 | |
| 非放射性分子 | |||
| 生物素 | Bio-11-dUTP | NT、TL、PCR | 酶标亲合素或酶标抗生物素抗体显色 |
| 光敏生物素 | 600W 可见光照 | 同上 | |
| 生物素化补骨脂素 | 365nm紫外线照 | 同上 | |
| 生物素酰-e-氨基乙酸 | 化学合成法 | 同上 | |
| N-羟基丁二酰亚胺脂 | 酶标亲合素或酶标抗生物素抗体显色 | ||
| 生物素肼 | 化学合成法 | 酶标亲合素或酶标抗生物素抗体显色 | |
| 酶 | 微过氧化物酶 | 直接法或合成法 | 直接底物显色或用酶标抗体+ 底物显色 |
| 碱性磷酸酯酶 | 直接法或合成法 | 同上 | |
| 荧光素 | 罗丹明和FITC | 合成法 | 直接荧光显微镜观察或酶标抗体+ 底物显色 |
| 化学发光标记物 | 化学发光测量或自显影 | ||
| 抗双链单抗 | 酶标或荧光标记单抗 | 化学法 | 直接底物显色 |
| 稀有金属 | Eu3－ | 化学法 | 时间分辨荧光 |
| 重金属 | Ag | 化学法 | |
| Hg | 化学法 | ||
| 半抗原 | 磺酸胞嘧啶 | 化学法 | 酶标单抗 + 底物显色 |
| 地高辛 | RPL | 酶标抗体 + 底物显色 |
* ：NT：缺口平移； PCR：聚合酶链反应；RPL： 随机引物标记； TL：末端标记
4．非放射发光自显影若将AP或HRP的显色底物根据光化学原理换成一种酶解后产生光子的化合物，可用自显影技术暴光X线片显示。
（1）HRP发光自显影：氨基苯-甲酰肼在HRP与H2O2的作用下氧化为氨基苯二甲酸，同时放出N2及发光（波长428nm）。发光时加入某些酚的衍生物时可增强发光上千倍。反应如下图：
（2）AP的发光自显影：AP的发光底物是金刚烷二氧丁环磷酸盐（AMPPD），它含有磷酸酯键在AP的作用下水解下一个磷酸，进而由分子内过氧键提供能源分解产生金刚酮和激发态的甲基间-氧苯甲酸阴离子，当此阴离子恢复到基态时发出光子。可用波拉黑白片（621型）直接暴光显影。显影信号强度比BCIP/NBP显色法强两上数量级。是很前景的显示体系。
其发光反应的原理如下：
HRP的发光原理：
AP的发光原理：
